基督徒基础证书 (6学分)
基督徒基础证书是基督徒领袖学院授予的第一个证书。这一证书包括两门课程，基督徒领袖的培养和基本要道。课程覆盖的是基督徒所信基本的信仰，和基督徒与上帝同行的生活操练中的重要关系。这是刚刚信主的基督徒和寻求基督徒坚固自己生命根基的基督徒必须了解的基本要道。这一阶段的学习也是为深入学习打下坚固根基的课程。
入门课程: 领导力培养(3学分)
基督徒基础：基督教教义导论(3学分)
总学分: 6学分
基督徒领袖圣经证书(12 学分)
基督徒领袖证书课程是在基督徒基础证书的基础上，对整卷圣经进一步的学习。在这一学习过程中，学生会对整卷圣经中的历史、文学、神学、对基督徒的实际生活意义进一步学习。这是适合所有愿意深入理解圣经的人的预备课程。
入门课程: 领导力培养(3学分)
基督徒基础：基督教教义导论(3学分)
旧约概览(3 学分)
总学分: 12学分
圣经研究证书 (17 学分)
在获得基督徒领袖圣经证书的基础上，圣经研究证书，是学生完成教会中圣经学习领袖所需的核心课程后获得的证书。它包括作为基督徒所必须了解的基本要道，和对旧约及新约圣经的深入学习。除这些课程外，学生也必须学习与教会中领袖位置相关的责任，如何组织圣经学习，如何教导圣经，并建立引导他人与上帝同行的关系。
入门课程: 领导力培养(3学分)
基督徒基础：基督教教义导论(3学分)
旧约概览(3 学分)
教牧关怀和婚姻（3学分）
中华文化处境下侍奉的智慧（2学分）
总学分: 17学分
基督徒领袖证书 (23 学分)
基督徒领袖证书，是学生完成成为教会领袖所需的核心课程后获得的证书。课程内容包括，作为基督徒所必须了解的基本要道，对旧约及新约圣经的深入学习。除这些课程外，学生也必须学习教会史，与作为教会领袖职份相关的责任。
入门课程: 领导力培养(3学分)
基督徒基础：基督教教义导论(3学分)
旧约概览(3 学分)
教牧关怀和婚姻（3学分）
中华文化处境下侍奉的智慧（2学分）
教会与侍奉（3学分）
中国教会史（3学分）
进深侍奉文凭(23 学分)
进深侍奉是基督教领导力研究院最灵活的课程。正如其他课程一样，这一学习也是从“基督徒基础证书”开始的。学员在完成基础证书之后，可以选择自己感兴趣的课程，达到 23学分以后，即可获得相应的学习证书。这是教会牧师或其他基督徒领袖为了寻求充实自己的知识或生命更新而设置的课程。